# 安装 phylokit-mcp

- 类型: MCP 工具
- 说明: Phylogenetic inference via IQ-TREE 3 — never returns a topology without its support
- 仓库: https://github.com/musharna/phylokit-mcp

## 方式一 · 一键代装（复制提示词让 AI 代劳）

### Claude Code
```
请帮我安装 askskill 上的 "phylokit-mcp" MCP 服务：
执行：claude mcp add 'io-github-musharna-phylokit-mcp' -- uvx phylokit-mcp
```

### Codex
```
请帮我安装 askskill 上的 "phylokit-mcp" MCP 服务：
在 ~/.codex/config.toml 中添加：
[mcp_servers.io-github-musharna-phylokit-mcp]
command = "uvx"
args = ["phylokit-mcp"]
然后重启 Codex 生效
```

### Cursor
```
请帮我安装 askskill 上的 "phylokit-mcp" MCP 服务：
在 .cursor/mcp.json 的 "mcpServers" 中添加：
"io-github-musharna-phylokit-mcp": { "command": "uvx", "args": ["phylokit-mcp"] }
然后在 Cursor 设置 > MCP 中启用
```

## 方式二 · 命令行安装（原生命令与配置）

### Claude Code
```bash
claude mcp add --env OMP_NUM_THREADS=YOUR_VALUE --env MKL_NUM_THREADS=YOUR_VALUE --transport stdio io-github-musharna-phylokit-mcp -- uvx phylokit-mcp
```
需要环境变量：OMP_NUM_THREADS, MKL_NUM_THREADS

### Codex
```bash
codex mcp add --env OMP_NUM_THREADS=YOUR_VALUE --env MKL_NUM_THREADS=YOUR_VALUE io-github-musharna-phylokit-mcp -- uvx phylokit-mcp
```
配置文件 ~/.codex/config.toml：
```toml
[mcp_servers.io-github-musharna-phylokit-mcp]
command = "uvx"
args = ["phylokit-mcp"]

[mcp_servers.io-github-musharna-phylokit-mcp.env]
OMP_NUM_THREADS = "YOUR_VALUE"
MKL_NUM_THREADS = "YOUR_VALUE"
```
需要环境变量：OMP_NUM_THREADS, MKL_NUM_THREADS

### Cursor
配置文件 .cursor/mcp.json：
```json
{
  "mcpServers": {
    "io-github-musharna-phylokit-mcp": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "phylokit-mcp"
      ],
      "env": {
        "OMP_NUM_THREADS": "YOUR_VALUE",
        "MKL_NUM_THREADS": "YOUR_VALUE"
      }
    }
  }
}
```
一键安装：cursor://anysphere.cursor-deeplink/mcp/install?name=io-github-musharna-phylokit-mcp&config=eyJjb21tYW5kIjoidXZ4IiwiYXJncyI6WyJwaHlsb2tpdC1tY3AiXSwiZW52Ijp7Ik9NUF9OVU1fVEhSRUFEUyI6IllPVVJfVkFMVUUiLCJNS0xfTlVNX1RIUkVBRFMiOiJZT1VSX1ZBTFVFIn19
需要环境变量：OMP_NUM_THREADS, MKL_NUM_THREADS